Trong công nghệ sản xuất protein tái tổ hợp, E. coli được coi là cỗ máy trung tâm quan trọng nhờ đặc điểm dễ cải biến di truyền, khả năng sinh sản nhanh trên nhiều loại cơ chất khác nhau và sản xuất protein với hàm lượng cao. Kết quả sản xuất protein của E. coli phụ thuộc rất nhiều vào thành phần nito, mà đa phần phức tạp rất khác nhau, của môi trường dinh dưỡng và thời điểm kích thích quá trình tích lũy protein.